峠之釜飯在荻野屋的兩間工場製作，一間在群馬縣的橫川，另一間在長野縣的諏訪。飯和配料在那裏煮好，再裝進用蒸氣清洗過的益子燒陶釜。兩間工場合計，一天可以製作約 52,000 份。
兩間工場
兩間工場都設在荻野屋的店舖旁邊。橫川店旁邊的一間稱為「Central Kitchen」，另一間在諏訪店旁邊。兩間工場也製作幕之內便當。
| 工場 | 峠之釜飯（每小時） | 峠之釜飯（每日） | 幕之內便當（每日） |
|---|---|---|---|
| Central Kitchen（橫川） | 約 3,600 個 | 約 37,000 個 | 約 7,000 個 |
| 諏訪 | 約 1,600 個 | 約 15,000 個 | 約 7,000 個 |
以上是每間工場的最高產量。米是越光米，由荻野屋自行碾米，加入利尻昆布和高湯煮成；九種配料則每一種分開預備。
用蒸氣清洗的陶釜
陶釜和釜蓋在盛裝之前，會用 85°C 的蒸氣清洗，藉此殺菌。用過一次、回收後再用的陶釜，會用蒸氣清洗兩次。這股熱力還有另一個作用：經高溫殺菌的陶釜能夠保溫，所以釜飯送到顧客手上時仍是暖的。
每 30 分鐘洗手一次
員工每 30 分鐘必定洗手一次，洗手之後再用乙醇殺菌，連指尖也不遺漏。全身經過風淋，把衣服上的灰塵吹走。消毒液大約每兩小時更換一次；濃度會加以檢查，一旦變得混濁便立即更換。
煮好的配料和飯要檢查溫度，以確認已經徹底加熱，而每款產品的加熱溫度都會量度和記錄。生產線每天最少停下來清潔六次。工場各處都裝有紫外線殺菌燈。
店舖同樣有衞生管理。荻野屋每間公路餐廳店舖都長期有二至四名衞生人員當值，負責檢查和清潔。每月 1 日和 15 日是「清潔日」，會清潔店舖和店舖周圍。
自 1957 年起
荻野屋早在數十年前、這種做法尚未普及的時候，已開始用次氯酸鈉和乙醇消毒。1957 年，即峠之釜飯開售的前一年，橫川的工場獲頒厚生大臣獎。
其後，諏訪的工場在 1999 年和 2010 年、橫川的工場在 2009 年，先後獲頒大臣獎。2010 年，Central Kitchen 取得群馬縣食物衞生制度的認證，這個制度以 HACCP 的原則為基礎。
參考資料
- Oginoya online shop: Safety and hygiene
- Oginoya online shop: What makes Tōge no Kamameshi taste the way it does
- Oginoya: About the containers
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